在這個(gè)星球上，曾經(jīng)有過(guò)一種生物，喚作“人類”。故事發(fā)生在距今遙遠(yuǎn)的未來(lái)，地球上僅剩下28個(gè)擁有寶石之身的人形生命體，以及統(tǒng)領(lǐng)著他們的“金剛老師”。28個(gè)寶石各由不同成分的礦物所組成，也因此有不同的特質(zhì)，除了物理上的身體硬度、韌性外，內(nèi)在個(gè)性也截然不同。在他們身上，沒(méi)有所謂的性別，也沒(méi)有所謂的死亡，即使粉身碎骨，也還是有重組而“死而復(fù)生”的可能。

而為了抵抗欲將寶石帶回月球作為裝飾、日復(fù)一日前來(lái)侵襲的神秘種族“月人”，他們?yōu)楸舜朔峙淞瞬煌穆氊?zé)，并兩兩組成戰(zhàn)斗小組，隨時(shí)備戰(zhàn)。但其中硬度低、韌性最為下級(jí)的“磷葉石”，由于太過(guò)軟弱，即使一心想要戰(zhàn)斗，卻未被分配到任何職務(wù)，最后被金剛老師分配了“編寫博物志”這個(gè)任務(wù)。不知從何做起的磷葉石，決定從找尋“尚未知曉”的事物開始，此時(shí)他被建議詢問(wèn)從不在白天出沒(méi)、其他寶石也都知之甚少的“辰砂”：他擁有強(qiáng)大戰(zhàn)斗實(shí)力，卻因會(huì)散發(fā)毒液而將自己禁閉于黑夜。在試著接近這個(gè)神秘同伴的過(guò)程，軟弱的磷葉石心中開始產(chǎn)生了變化，故事由此展開……